eRA Adventskalender Türchen 19: FAIR Compliant Data Management in Plant Science und Sequenzierung

Heute beschäftigt sich der eRA- „Adventskalender“ mit einer Präsentation und einem Poster von FDM@Campus.

Erfolge von Datenmanagement im Bereich der Sequenzierung – Danuta Schüler et al., Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung Gatersleben

Ein Schwerpunkt des Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK) ist die Erschließung und Bewahrung pflanzengenetischer Ressourcen. Damit verbundenen Datenmanagementprozesse werden in einem Laborinformationsmanagementsystem umgesetzt. Hier werden Labor-Serviceprozess mit Datenerhebungen in Forschungsprojekten nach FAIR-Kriterien zu gemeinsamen Prozessen zusammengeführt. Dazu gehört u.a. die Hochdurchsatz-Sequenzierung. Im Vortrag werden Lösungsansätze von LIMS-basierten Datenmanagementlösungen im Bereich der Sequenzierung, die Umsetzung der Anforderungen an FAIR-Prinzipien und die Herausforderung der Nutzung/Schulung der Nutzer aufgezeigt. Dazu gehören neben der Sicherstellung konsistenter, kurierter Daten auch harmonisierte, maschinenverarbeitbare Datenzugriffe zur Entwicklung von Webportalen, sowie die standardkonformen Datenpuplikationsprozesse, etwa zu den INSDC Datenbank ENA und BioSamples.

Sie finden die Präsentation auf zenodo.

 

Research and Laboratory Information System for FAIR Compliant Data Management in Plant Science – Danuta Schüler et al., Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung Gatersleben

Sie finden das Poster auf zenodo.